Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdk13Q69ZA1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk13Q69ZA1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms