Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kiaa1549Q68FD9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kiaa1549Q68FD9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms