Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PatjQ63ZW7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PatjQ63ZW7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms