Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic2Q62520 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zic2Q62520 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms