Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn3Q62471 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn3Q62471 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms