Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha6Q62413 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha6Q62413 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms