Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SypQ62277 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SypQ62277 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SypQ62277 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SypQ62277 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SypQ62277 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SypQ62277 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SypQ62277 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SypQ62277 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SypQ62277 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SypQ62277 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SypQ62277 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SypQ62277 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SypQ62277 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SypQ62277 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SypQ62277 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SypQ62277 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SypQ62277 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SypQ62277 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SypQ62277 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SypQ62277 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms