Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall3Q62255 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms