Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm38Q62176 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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Rbm38Q62176 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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