Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pde3bQ61409 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde3bQ61409 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms