Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JrkQ60976 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JrkQ60976 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms