Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Meis1Q60954 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Meis1Q60954 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms