Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PmelQ60696 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PmelQ60696 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PmelQ60696 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.1 ms