Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClpbQ60649 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms