Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ssh2Q5SW75 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms