Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms