Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CenpjQ569L8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpjQ569L8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms