Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q504N7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q504N7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q504N7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q504N7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q504N7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q504N7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q504N7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms