Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms