Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a5Q4LDG0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a5Q4LDG0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms