Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms