Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr7Q3V0I2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr7Q3V0I2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr7Q3V0I2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms