Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrfip1Q3UZ39 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms