Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms