Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl5Q3UTQ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl5Q3UTQ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl5Q3UTQ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl5Q3UTQ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdkl5Q3UTQ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdkl5Q3UTQ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdkl5Q3UTQ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl5Q3UTQ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl5Q3UTQ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms