Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fchsd2Q3USJ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms