Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms