Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acsf3Q3URE1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acsf3Q3URE1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acsf3Q3URE1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acsf3Q3URE1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acsf3Q3URE1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acsf3Q3URE1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acsf3Q3URE1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms