Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms