Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Arhgef40Q3UPH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Arhgef40Q3UPH7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arhgef40Q3UPH7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms