Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms