Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms