Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cobll1Q3UMF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms