Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc33Q3ULW6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms