Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mier3Q3UHF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mier3Q3UHF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mier3Q3UHF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms