Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc177Q3UHB8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms