Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc174Q3U155 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms