Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Palb2Q3U0P1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palb2Q3U0P1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms