Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms