Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms