Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms