Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700066B19RikQ3TS39 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms