Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TQQ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TQQ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TQQ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms