Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XylbQ3TNA1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms