Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VrtnQ3SYK4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms