Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prr27Q3SYJ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms