Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q149G0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q149G0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q149G0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q149G0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q149G0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q149G0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q149G0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q149G0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q149G0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q149G0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q149G0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q149G0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q149G0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q149G0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q149G0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q149G0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q149G0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q149G0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms