Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp4r2Q0VGB7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms