Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne7Q0VE82 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms