Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou6f1Q07916 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pou6f1Q07916 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms