Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdk18Q04899 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdk18Q04899 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk18Q04899 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms